腫瘤學的基因組驅動基因的最初概念:
慢性骨髓性白血病，費城染色體導致了ABL與BCR的融合蛋白，稱為BCR-ABL (單一致癌基因)。爾後imatinib (Gleevac,伊馬替尼)在具有BCR-ABL易位的慢性骨髓性白血病患者有極高的控制率。

隨後，針對人類表皮生長因數受體2（HER-2）過度表達的乳癌或胃癌，BRAF V600E突變黑色素瘤以及EGFR，ALK和ROS1突變肺癌的藥物。使具有這些分子改變的癌症患者能夠大大延長預期壽命。

這些在識別和靶向癌症驅動基因組改變方面的早期成功，推動了根據個體腫瘤的基因組概況選擇治療策略的範例。基因組分析已成為某些癌症類型（例如肺癌，乳腺，黑色素瘤和結直腸癌）的治療標準。

為了深入瞭解不同癌症類型的基因組變化後，認識到可能在多種腫瘤類型中發生潛在可操作的基因組變化，儘管在任何單個腫瘤類型中的發生頻率較低。

針對特定基因改變的藥物會引起多種疾病的治療反應嗎？

藥物能否作用是基於基因組學變異情形，而不是針對癌症的發源處起作用？

為瞭解決這些問題，開發了一種新穎的臨床設計，稱為“籃子試驗”。

這是一種新的臨床試驗範例，可以根據特定基因變異的存在與否，來確定是否可以進入該臨床試驗，而與腫瘤組織學無關。這與過去專注於單一癌症組織學的傳統臨床試驗不同，籃子試驗的核心則著眼於腫瘤所發現的特定基因組改變，無論癌症發源於何處。籃子試驗實際上是2期篩查試驗，用於在基因組相同的患者中使用特定的靶向藥物，在精準醫療時代，它具有若干潛在優勢。

首先，籃子試驗可以為新發現的腫瘤驅動基因的臨床驗證提供初步的原理證據，特別是對於罕見、低發生頻率或孤兒的基因組變異，提供了臨床驗證。

由於所有參與研究的患者都有共同的基因變異，從而推動各種腫瘤類型之間的進展，因此理論上對特定標靶治療具有高度敏感性，是可能的。此外，這些基因組片段的低發生率使隨機性試驗具有挑戰性，因此籃子試驗對於研究靶標療法的療效是最佳的。

舉例來說，20多種癌症類型的NTRK（NTRK-1，2，3）易位的發生率低於1％。 而Drilon等人在55個患有TRK易位，跨越12種不同腫瘤類型的患者，使用了一項非比較之驅動基因的單臂籃子試驗，發現larotrectinib（LOXO-101，TRK抑制劑）的腫瘤反應率高達71％。這項研究對具有TRK易位的癌症患者的臨床實踐產生了重大影響，並且還說明瞭具有罕見基因改變的癌症藥物開發和臨床試驗，未來有發展潛力。

其次，籃子試驗可以篩查特定藥物於多種癌症類型的潛在療效，以指導針對特定疾病的追蹤性研究。一些籃子試驗目的在根據組織學特性，而評估標靶治療的療效的可能性。幾項此類試驗未能找到正在研究的靶向療法之抗腫瘤功效的證據。在vemerafinib的BRAF V600E突變患者的籃子試驗中，該藥物在非小細胞肺癌和其他幾種組織學中有活性，但在大腸直腸癌中丹用沒有活性。因此，可以分別在在非小細胞肺癌、黑色素瘤族群中進行了隨訪研究。

再者，籃子試驗可以透過根據基因組，選擇對最佳藥物而進行評估，從而確定新藥是否能夠有效抑制預期目標。在藥物開發中，臨床前試驗評估了靶標的體內和體外抑制作用。在安全性和毒性方面取得令人滿意的結果後，可以測試標靶藥物在腫瘤患者是否有抑制活性。

籃子試驗可以鑑定出在不同腫瘤類型中具有相同突變的患者，以實現臨床確認。例如，STARTRK-2研究是一項籃子研究，評估了RXDX-101（entrectinib）對具有NTRK1 / 2/3，ROS1或ALK基因融合的實體瘤患者的治療效果。共有54例進行NTRK基因融合的患者，腫瘤治療有效率為57.4％，中位整體存活期​​為20.9個月，而32例ROS-1融合患者的腫瘤治療有效率為78％，中位疾病無惡化時間為29.6個月，表明entrectinib表現出高效的對NTRK或ROS1抑制活性。

此外，籃子試驗可以產生支援新標準治療的關鍵數據。在臨床實踐中，某些癌症類型（例如Erdheim-Chester病和Langerhans細胞組織細胞增生症（LCH））目前缺乏建議的標準治療。在vemurafenib用於BRAF V600突變患者的籃子試驗中，患有Erdheim-Chester病或LCH的患者，可從vemurafenib獲得明顯的臨床益處。因此，該籃子試驗為這些具有BRAF突變的罕見癌症建立了標準治療。

另外一個例子，是對錯配修復（dMMR）/微衛星不穩定性高（MSI-H）的癌症患者進行PD-1免疫檢查點抑制劑的籃子試驗，證實了dMMR可以預測實體瘤的反應對PD-1免疫藥物的療效；該試驗已經讓pembrolizumab對於dMMR患者的FDA批准，無論其癌症來源如何。正是為患有dMMR / MSI-H的癌症患者提供了新的標準治療模式。

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