由於大多數免疫治療相關的不良事件在免疫抑制治療開始後數周至數月內消退，因此臨床實務面臨了最重要的問題，是在不良事件消退後，恢復免疫檢查點抑制劑的安全性。

目前來自前瞻性臨床試驗的數據是有限的，因為如果發生嚴重的免疫治療相關不良事件，研究方案通常要求是要永久停止免疫檢查點抑制劑。最近一項涉及黑色素瘤患者的回顧性研究顯示，在嚴重的ipilimumab相關不良事件需要免疫抑制藥物後，可以安全地給予抗PD-1治療。隨後的抗PD-1治療與低發率（3％)的復發免疫相關副作用有關。這些研究結果表明，毒性可能是治療特異性的，而不是在各種類型的免疫檢查點抑制劑都是一般性的，。

更具體的是重新開始免疫治療的安全性問題。

一項回顧性研究描述了用抗PD-1或抗PD-L1治療的非小細胞肺癌患者，這些患者有免疫相關的不良事件而需要延後治療、或用類固醇治療或是兩者，後來再次用抗PD-1或抗PD-L1治療。在38名再次免疫治療的患者中，50％沒有進一步發生免疫相關不良事件，24％的患者又發生了類似初始的免疫事件，26％的患者產生新事件。

因此，臨床醫生應該認識到，在解決免疫相關副作用後，重新再開始免疫治療，可能會引發再一次同樣或新的免疫相關副作用。雖然再度發作的不良事件通常不如最初的事件嚴重（可能是因為加強了監測），但決定是否再度重新免疫治療，應該要考量先前免疫副作用的嚴重程度，與替代治療方案的可行性以及癌症的總體狀況。

免疫檢查點抑制劑重新開始治療的絕對禁忌症，是先前出現危及生命的毒性，特別是心臟，肺或神經毒性。