雖然免疫抑制藥物會否降低抗腫瘤療效的理論與風險，都尚未得到證實，但免疫抑制確實帶來了臨床醫生應該要考慮到的額外風險。

具體而言，類固醇的使用可導致高血糖，如果類固醇減量過於迅速，則會引起液體瀦留，焦慮以及醫源性腎上腺皮質功能不全。雖然很少需要長期類固醇治療免疫相關的不良事件，因為這種長期類固醇治療可能導致其他併發症，例如庫興氏症候群，骨質疏鬆症，青光眼，伺機性感染和近端肌肉無力的衰弱。

此外，用於治療免疫相關不良事件的免疫抑制藥物，可能會使患者面臨伺機性感染的風險增加，例如麴菌性Aspergillus fumigatus肺炎，巨細胞病毒性肝炎和肺孢子蟲肺炎。

在一項回顧性研究中，790例接受免疫治療的晚期黑色素瘤患者，接受類固醇或infliximab治療免疫相關不良事件的患者亞組，嚴重感染率為13.5％。

鑑於這種伺機性感染的潛在風險，當患者每天需要prednisolone 20毫克或藥效相當的其他類固醇藥物於至少4週時，應考慮用trimethoprim–sulfamethoxazole, atovaquone，或pentamidine預防卡氏肺孢子蟲。