- 分類:精準醫療
- 作者 陳駿逸
- 點擊數:20
人類外顯子基因定序(Whole Exome Sequencing, WES)在癌症中的應用
陳彥瑜博士撰文
英國劍橋大學藥物基因醫學博士
健曜國際有限公司研發長/共同創辦人
長庚醫院精準醫學計畫專案顧問
曾任 長庚大學智慧醫療創新學程兼任教授
怡仁醫院LDTs基因體實驗室主任
麗寶生醫股份有限公司生物資訊長兼分子檢測處長
林口長庚醫院生物資訊中心主任
新加坡科技部(A*STAR)研究計畫外審委員
美國系統生物研究所(ISB)研究科學家
英國威爾康、桑格研究院(Wellcome Sanger Institute)科學家
人類外顯子基因定序(Whole Exome Sequencing, WES)是一種基於次世代基因定序技術的基因檢測應用,針對人類基因的蛋白質編碼基因(外顯子)進行測序,主要應用於找尋與疾病相關的基因變異。在癌症研究與臨床應用中,WES能提供關鍵的遺傳資訊,幫助診斷與預測疾病進程、指導治療選擇以及監測癌症手術與藥物治療後的復發。
WES在癌症研究與診斷的應用
由於癌症的發生通常是因為後天器官組織細胞癌基因突變(體細胞突變,somatic mutations)或先天遺傳性癌基因突變(germline mutations),WES因此可用於檢測腫瘤組織的體細胞突變,如驅動基因突變(driver mutations)與耐藥性相關突變,以提供精準的癌細胞分子分型以利標靶藥物的選擇。例如:在肺癌、乳癌與黑色素瘤等癌症中,WES可識別EGFR、BRCA1/BRCA2和BRAF突變,幫助選擇適合的標靶藥物。此外,對於家族性癌症,WES可檢測遺傳性致病突變,如遺傳性大腸癌(Lynch syndrome)或遺傳性乳癌卵巢癌(HBOC),提供風險評估與家族諮詢。
WES在循環腫瘤DNA(circulating tumor DNA, ctDNA)檢測中的應用
近年來,液態活檢(liquid biopsy)成為癌症檢測的重要技術,而ctDNA分析更是蓬勃發展與廣泛應用。ctDNA是由腫瘤細胞釋放至血液中的DNA片段,因此針對ctDNA進行分析可作為無創性癌症監測工具。目前市面上的ctDNA檢測因技術限制,僅針對少數特定的基因進行分析。我們的實驗室突破技術限制,透過WES解析ctDNA,故能夠全面偵測腫瘤特異性突變,實現癌症早期偵測、治療反應監測與復發預測。例如,在肺癌患者中,WES可從ctDNA檢測EGFR T790M、L858R突變與exon 19缺失,幫助選擇第三代EGFR抑制劑(如Osimertinib)。
癌症患者可以利用深度WES檢測幫助臨床醫師選擇最合適並即時調整治療策略,實現精準個人化醫療。隨著基因定序技術進步與成本降低,我們提供最先進的癌症診斷與監測WES分析,幫助臨床醫師提升癌症患者的存活率與生活品質。