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大數據分析看癌症免疫治療的療效預測標記物的選擇

免疫治療目前正夯,然而關於免疫治療療效預測的確切標記物,目前尚未明確,而且莫衷一是。臨床基因資料庫已經有許多個案且有接受免疫治療,經由大數據分析看癌症免疫治療的療效預測標記物的選擇,真實世界接受免疫治療的人群中分析患者的臨床基因特徵,可能是發現較適合族群的方法之一。

 

於2017年9月的歐洲腫瘤醫學會年會ESMO,發表了一項研究其方法如下:

 

研究收錄了Flatiron健康分析資料庫中,接受了Foundation Medicine廣泛基因組定序(CGP)的2139例非小細胞肺癌患者。CGP檢測包括了313個癌症基因和腫瘤突變負荷量(TMB)。將TMB分為3類:低(TMB-L;<6mt/MB);中(TMB-I;6-20mut/MB);高(>=20mut/MB)。PD-L1表達由患者所在醫院的實驗室進行免疫組織化學染色IHC的PD-L1檢測(採用不同的抗體)。將基因檢測資料和患者的電子病歷資料聯結起來,nivolumab免疫治療的療效評價為腫瘤客觀緩解率 (ORR)(腫瘤客觀緩解率 (ORR)=穩定,部分腫瘤緩解,或全部腫瘤緩解),中位療效持續時間(DOT)和中位整體存活時間(OS)(分別自診斷為晚期腫瘤開始計算或自nivolumab使用開始計算)。

 

 


研究結果如下:

 

接受nivolumab治療的111位患者,高腫瘤突變負荷量相較於中/低腫瘤突變負荷量者顯示出有更長且有顯著差異的中位療效持續時間(分別是7.5與 4.6個月),更長的且有顯著差異的整體存活時間(分別是未達到與10個月)。

 

然而,PD-L1表達水平狀態和患者的腫瘤客觀緩解率 (ORR)、中位療效持續時間(DOT)和中位整體存活時間(OS)並無相關性。在PD-L1表達呈現陰性的患者中,如果屬於高腫瘤突變負荷量者相較於中/低腫瘤突變負荷量者,反而有較高的腫瘤客觀緩解率 (ORR)(分別是100與62%)、較長的中位療效持續時間(DOT)(分別是391與166 天個月)。

 

分析中還調整了患者的組織學類型,年齡,分期,吸煙史、性別和種族的多重因素後,分析結果發現腫瘤突變負荷量仍然是能夠預測中位療效持續時間(DOT)和中位整體存活時間(OS)的獨立預測因子。而在低腫瘤突變負荷量者的患者中,發現了2個額外且有高度意義的的可以預測nivolumab治療持續時間的基因標記物,分別是BRAF (HR: 0.12)和BRCA 1/2 (HR :0.05)。制劑治療的較適合族群。本研究發現腫瘤突變負荷量可以作為預測免疫檢查點抑制劑療效的重要因子,相較於當地實驗室進行免疫組織化學染色IHC的PD-L1檢測,採用精準醫學的腫瘤突變負荷量可能可以更好的找出能從免疫治療中獲益的患者。縱使低腫瘤突變負荷量者的患者中,也可能靠其他新的預測標記,能夠發掘出從免疫治療中潛在受益的患者。

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